pcr延伸时间?PCR延伸时间设长了

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本文目录

  1. PCR延伸时间是不是和扩增片段大小有关
  2. 做pcr,如何确定更佳退火及延伸的时间和温度
  3. PCR的延伸时间怎么确定
  4. PCR实验设置延伸反应的原因
  5. pcr循环过程中为什么预变 *** 的时间要长一些
  6. PCR延伸时间不够或者过长会怎么样
  7. pcr反应中延伸的时间取决于

一、PCR延伸时间是不是和扩增片段大小有关

PCR延伸时间上,实验室一般用95℃/30秒变 *** ,55℃/45秒退火,用的是95℃/20秒变 *** ,55℃/30秒退火。上面说的是常用的条件,如果扩增不出来就降低退火温度,特异 *** 不高就提高退火温度,一般都能做出来的。

耐热DNA聚合酶-Taq酶的发现对于PCR的应用有里程碑的意义,该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活,不需要每个循环加酶,使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本,PCR技术得以大量应用,并逐步应用于临床。

PCR技术的基本原理类似于DNA的天然 *** 过程,其特异 *** 依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变 *** -退火-延伸三个基本反应步骤构成:

pcr延伸时间?PCR延伸时间设长了-第1张图片-

①模板DNA的变 *** :模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;

②模板DNA与引物的退火(复 *** ):模板DNA经加热变 *** 成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;

③引物的延伸:DNA模板-引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留 *** 原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留 *** 链;

重复循环变 *** -退火-延伸三过程就可获得更多的“半保留 *** 链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。

二、做pcr,如何确定更佳退火及延伸的时间和温度

退火的目的是为了使引物和DNA单链结结合,所以退火温度一定要低于目的DNA和引物的熔点温度。一般情况下引物的熔点温度为40~70度,熔点温度的高低与引物的大小与G+C的比例有关。延伸的温度取决于DNA聚合酶的最适温度,聚合的错配率,引物的熔点温度。最常使用的延伸温度为72度。但是根据你要扩增的产物与引物还是会有差距。

三、PCR的延伸时间怎么确定

1、退火温度低于引物Tm值5℃左右,一般在45~55℃。

退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值(Tm值=4(G+C)+2(A+T))为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对PCR的特异 *** 有较大影响。

2、延伸时间:1min/kb(10kb内)。

引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。

四、PCR实验设置延伸反应的原因

不知道你说的是PCR循环中的延伸还是循环结束后的终延伸。循环中的延伸步骤实际上是让taq聚合酶开始合成DNA,taq聚合酶是高温活 *** 酶,在72度的时候合成DNA。如果是循环结束后的5~10分钟终延伸,它的作用实际上是起到一个补偿作用,有时候你循环过程中的延伸时间没有控制好,聚合酶并没有延伸完毕就开始下一个循环了,这样一个终延伸可以使未合成完的DNA补完。另外还有就是使末端加A充分。

五、pcr循环过程中为什么预变 *** 的时间要长一些

在PCR循环中,预变 *** 的时间会比其他扩增步骤的时间长一些,这是因为:

1、Denat *** ation(变 *** )步骤需要更长的时间来使DNA双链分离成两条单链,以便于后续的引物结合;

2、在预变 *** 时,反应体系中的酶和其他组分可以被充分激活,从而提高PCR反应的效率和特异 *** ;

3、较长的预变 *** 时间还有助于消除模板DNA上的二级结构或配对,使其更易于被引物识别和扩增。PCR循环:高温变 *** -低温复 *** -适温延伸过程,在合适条件下不断重复这个过程。

六、PCR延伸时间不够或者过长会怎么样

除非你特意设置非常短的时间,一般时间都是够得,Taq酶每分钟可以延伸1000bp。如果时间太短的话,扩不出目的条带,导致电泳图谱一片糊而没有主带;扩增时间过长的话会增加非特异 *** 扩增的可能 *** ,因为更远位置的非特异 *** 结合位点也有足够的延伸时间。

七、pcr反应中延伸的时间取决于

1、pcr反应中延伸的时间取决于待扩增片段的长度。

2、聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA *** ,PCR的更大特点是能将微量的DNA大幅增加。

3、PCR是利用DNA在体外摄氏95°高温时变 *** 会变成单链,低温时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度,DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖的方向合成互补链。基于聚合酶制造的PCR仪实际就是一个温控设备,能在变 *** 温度,复 *** 温度,延伸温度之间很好地进行控制。

4、DNA的半保留 *** 是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变 *** 解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则 *** 成同样的两分子拷贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变 *** 解链,当温度降低后又可以复 *** 成为双链。

OK,关于pcr延伸时间和PCR延伸时间设长了的内容到此结束了,希望对大家有所帮助。

标签: 延伸 时间 pcr

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